Jag är doktorand inom Skogspatologi vid Institutionen för Sydsvensk Skogsvetenskap sedan 2020. Huvudhandledare är Michelle Cleary (docent vid samma institution) och avhandlingen kommer att utgöras av flera fristående men sammanlänkande forskningsprojekt, bland annat:
- VOCs-baserad detektion av Fusarium circinatum, patogenen som är ansvarig för tallens hartskräfta, en allvarlig sjukdom med allvarliga ekonomiska och ekologiska konsekvenser. Patogenen kan angripa många arter av tall och douglasgran. För ett land som Sverige, där våra skogar till cirka 40% utgörs av Pinus sylvestris, en tallart som är mottaglig för sjukdomen, vore en etablering av sjukdomen extremt förödande. Projektet gjordes i samarbete med en spansk forskningsgrupp inom skogspatologi som leds av Julio Javier Diez Casero, Universidad de Valladolid.
- VOCs analys för identifiering av infektion orsakad av Phytophthora spp. hos Fagus sylvatica och Quercus robur, och för särskiljning av nära besläktade Phytophthora spp. odlade in vitro.
- Illumina versus Nanopore sequencing: Jämförelse av nästa generationens sekvenseringsteknik, med potential för användning i fält och identifiering av skogspatogener, gentemot den redan etablerade Illumina-plattformen med avseende på prestanda och precision. Skogspatogener uppvisar typiskt sett mycket lika symptom och är mycket svåra att särskilja med blotta ögat. Med hjälp av nästa generationens sekvenseringstekniker så har vi möjlighet att utveckla metoder som möjliggör identifiering av patogener direkt i fält, genom extraktion av DNA och resultat som matchas mot relevant databas i realtid.
