CV-sida

Gabriella Lindgren

Gästprofessor, Institutionen för Biosystem, KU Leuven, Belgien, sedan februari 2018. Universitetslektor i molekylär husdjursgenetik, sedan juni 2011.

Presentation

Jag har alltid varit intresserad av biologi, och började tidigt intressera mig för hästar och genetik. Jag började rida när jag var åtta och har tidigare haft ett svenskt varmblodssto som jag tog två föl från.

Undervisning

Jag undervisar på Master- och Forskarutbildningskurserna i Genomanalys och genetikdelen i Biomedicinsk baskurs. Dessutom undervisar jag i genetik på grundkursen Biologi 2. Varje år brukar jag handleda 2-4 studenter på grundnivå, oftast handlar det om masternivå. Vid KU Leuven undervisar jag på kursen "Livestock genetics" (masternivå).

Forskning

Hästens gångarter, fysisk prestation och sjukdomar – genetik och genomik

Sverige är det land i Europa som har flest hästar per capita och där ridning är en av de sporter som har flest antal utövare. Hästar avlas för att vara friska, hållbara och för att kunna prestera på topp. Ett viktigt mål med min forskning är att möjliggöra urval av friska och elitpresterande avelsdjur mer exakt. Detta görs genom att identifiera gener och mutationer som styr kritiska fysiska egenskaper.

Jag studerar tamhästar och genetiken som reglerar deras fysiska prestationsegenskaper och rörelsemönster, beteende av vikt för atletisk prestation (flykt- och kampresponsen), allergiskt eksem och krumma föl (skeletal atavism). I min forskning kombinerar jag både genomik, molekylärgenetik, cell- och beräkningsverktyg samt djurmodeller för att undersöka genvarianter och hur de påverkar fenotypen.

En stor utmaning inom biologin är förklara hur en endimentionell serie av nukleotider kan utgöra hela kartan för en tredimetionell organism. Att bestämma hur generna fungerar och regleras är ett krav för att man ska kunna förstå den processen.

Sedan början av 2017 har jag även engagerat mig i ett projekt som handlar om att förstå de molekylära mekanismer som reglerar varför ett hårstå växer genom att använda hästen som modelldjur. Jag deltar också i ett projekt där vi studerar grisars exteriör och rörelser.

Vimeo EU finansierade projektet HORSEGENE.

Samverkan

Jag samverkar med en rad olika hästavelsföreningar och hästföretag i Sverige och Europa.

Bakgrund

Utbildning

Agronomexamen, (MSc). Bioteknikinriktning, SLU, 1996

Doktorsexamen i ämnet Evolutionär genetik, "Genome analysis in the horse". Institutionen för Evolutionsbiologi, Uppsala Universitet, Sverige, 2001.

Docent sedan maj 2009.

Tidigare anställningar och postdoc

Forskarassistent 2007 –2011. Institutionen för husdjursgenetik, SLU, Sverige
Februari - April 2007. Visiting scientist, Omics Science Center, RIKEN Yokohama Institute, Yokohama, Japan
2004 - 2007. KA Wallenberg Research Fellow (Forskare). Inst. för Medicinsk Biokemi and Mikrobiologi, Uppsala Universitet, Sverige
2002 – 2003. Post doctoral researcher, Department of Genetics, Stanford University School of Medicine, Palo Alto, CA, USA
January - February 2002. Visiting scientist, Perlegen Sciences Inc., Mountain View, CA, USA
June - December 2001. Forskare, Institutionen för Evolutionsbiologi, Uppsala Universitet, Sverige
1999 – 2001. Doktorand. Institutionen för Evolutionsbiologi, Uppsala Universitet, Sverige
1997 – 1998. Doktorand. Institutionen för husdjursgenetik, SLU, Sverige

Yrkeserfarenhet och utmärkelser

Editor för Heredity (https://www.nature.com/hdy/)
Medlem av International Equine Genetic Diversity Consortium
Medlem av the Horse Genome Haplotype Committee
Vinnare av SKAPA innovationspris (Årets Innovatör) i Uppsala län 2012. Priset delades med Lisa S Andersson och Leif Andersson.
En av grundarna av Capilet Genetics, Inc. (grundat 2011)
En av flera uppfinnare till det godkända patentet "A method to predict the pattern of locomotion in horses."
En av flera uppfinnare till det ansökta patentet: A method to predict skeletal atavism in horses.
SLUs förtjänstmedalj i silver. 2015

Handledning

Jag är handledare åt tre doktorander

Maria Rosengren. "Ursprunget till en växande man hos den domesticerade hästen: en innovativ modell för att kartlägga gener som reglerar hårtillväxt. Huvudhandledare. The Swedish Research Council (VR).
Miguel Novoa Bravo. "“GENETICS OF COLOMBIAN PASO HORSE; PHYLOGENETICS, BIOTYPE, AND GAITS". Utbytesdoktorand från Colombia. Biträdande handledare. Driftkostnader finansieras av forskningsrådet Formas.
Tabassom Mohajershojai. "Genetics of reproduction in horses". Utbytesdoktorand från Iran. Biträdande handledare.

Jag var huvudhandledare för Lisa S. Andersson, som försvarade sin avhandling den 28 september 2012 och Kim Jäderkvist Fegraeus, som försvarade sin avhandling den 2o oktober 2017.

Jag var biträdande handledare för Helena Chalkias, som försvarade sin avhandling den 6 december 2013 (SLU), Freyja Imsland som försvarade sin avhandling den 25 september 2015 (Uppsala Universitet) och co-promotor för Liesbeth François som försvarade sin avhandling den 29 januari 2018 (KU Leuven).

Jag var huvudhandledare för Merina Shrestha från augusti 2012 till och med augusti 2015. Merina försvarade sin avhandling den 27 januari 2017 där 3 arbeten (artiklar) från min forskargrupp ingick i avhandlingen.

Jag är mentor för två post docs

Brandon D. Velie. 2015- pågående. Stiftelsen Hästforskning och EU projektet HORSEGENE.

Marina Solé. 2018 - pågående. Forskningsrådet Formas.

Jag var mentor för två post docs

Aneta Ringholm, 2005. Carl Tryggers Stiftelse.

Jeanette Axelsson, 2009 - 2011. Formas.

Jag har varit handledare för över 30 examensarbeten eller motsvarande.

Publikationer i urval

Publication list Gabriella Lindgren_180525.pdf

Imsland F, McGowan K, Rubin CJ, Henegar C, Sundström E, Berglund J, Schwochow D, Gustafson U, Imsland P, Lindblad-Toh K, Lindgren G, Mikko S, Millon L, Wade C, Schubert M, Orlando L, Penedo MC, Barsh GS, Andersson L. 2016. Regulatory mutations in TBX3 disrupt asymmetric hair pigmentation that underlies Dun camouflage color in horses. Nat Genet. 2016 Feb;48(2):152-8. doi: 10.1038/ng.3475. Epub 2015 Dec 21.

Kim Jäderkvist, Lisa Johansson, Minna Mäenpää, Anna Mykkänen, Lisa S. Andersson, Brandon D. Velie, Leif Andersson, Thorvaldur Árnason, Gabriella Lindgren. 2015.Different DMRT3 genotypes are best adapted for harness racing and riding in Finnhorses. J Hered. 2015 Nov-Dec;106(6):734-40. doi: 10.1093/jhered/esv062. Epub 2015 Aug 18.

Andersson LS, Larhammar M, Memic F, Wootz H, Schwochow D, Rubin CJ, Patra K, Arnason T, Wellbring L, Hjälm G, Imsland F, Petersen JL, McCue ME, Mickelson JR, Cothran G, Ahituv N, Roepstorff L, Mikko S, Vallstedt A, Lindgren G, Andersson L, Kullander K. (2012). Mutations in DMRT3 affect locomotion in horses and spinal circuit function in mice. Nature. 2012 Aug 30;488(7413):642-6. doi: 10.1038/nature11399.

Wade CM, Giulotto E, Sigurdsson S, Zoli M, Gnerre S, Imsland F, Lear TL, Adelson DL, Bailey E, Bellone RR, Blöcker H, Distl O, Edgar RC, Garber M, Leeb T, Mauceli E, MacLeod JN, Penedo MC, Raison JM, Sharpe T, Vogel J, Andersson L, Antczak DF, Biagi T, Binns MM, Chowdhary BP, Coleman SJ, Della Valle G, Fryc S, Guérin G, Hasegawa T, Hill EW, Jurka J, Kiialainen A, Lindgren G, Liu J, Magnani E, Mickelson JR, Murray J, Nergadze SG, Onofrio R, Pedroni S, Piras MF, Raudsepp T, Rocchi M, Røed KH, Ryder OA, Searle S, Skow L, Swinburne JE, Syvänen AC, Tozaki T, Valberg SJ, Vaudin M, White JR, Zody MC; Broad Institute Genome Sequencing Platform; Broad Institute Whole Genome Assembly Team, Lander ES, Lindblad-Toh K. (2009). Genome sequence, comparative analysis, and population genetics of the domestic horse. Science. 2009 Nov 6;326(5954):865-7. doi: 10.1126/science.1178158.

Lindgren G, Backstöm N, Swinburne J, Hellborg L, Einarsson A, Sandberg K, Cothran G, Vilà C, Binns MM & Ellegren H. (2004). Limited Number of Patrilines in Horse Domestication. Nature Genetics 36(4): 335-6.